Поиск информации в Uniprot о белке Periplasmic nitrate reductase в Uniprot
Таблица 1. Общая информациия о белке
| Uniprot ID | Uniprot AC | Refseq ID | PDB ID | Длина (амин.ост.) | Молекулярная масса (Да) | Рекомендуемое Uniprot название |
| NAPA_CUPNH | P39185 | WP_011154126.1 | 3ML1;
3O5A | 831 | 93346 | Periplasmic nitrate reductase |
Комментарии к таблице 1:
Согласно данным, полученным с сайта Uniprot, исследованный белок носит название Periplasmic nitrate reductase. Он характерен для организма Cupriavidus Necator (штамм ATCC BAA-471 / A3(2) / M145). Исходя из информации Uniprot, PE (степень достоверности) 1 означает, что выявлены эксперементальные доказательства существования белка. Белок был занесён в базы данных UniProtKB/Swiss-Prot 1 февраля 1995 года. Длина белка составляет 105 аминокислотных остатка, молекулярная масса составляет 11681 Да.
Структура белка известна полностью. Белок содержит две цепи.
Таблица 2. Информация о кластерах
| Uniref | Cluster ID | Cluster name | Size |
| Uniref100 | UniRef100_P39185 | Periplasmic nitrate reductase | 2 |
| Uniref90 | UniRef90_P39185 | Periplasmic nitrate reductase | 19 |
| Uniref50 | UniRef50_P39185 | Periplasmic nitrate reductase | 705 |
Результаты сеансов поиска в Uniprot
Поиск по белку Periplasmic nitrate reductase
1) Среди всех организмов
| Текст запроса: name:"Periplasmic nitrate reductase" |
| Сколько белков: 15012 |
| Сколько из раздела Reviewed: 375 |
2) В исходном организме
| Текст запроса: name:"periplasmic nitrate reductase" organism:"cupriavidus necator" |
| Сколько белков: 12 |
| Сколько из раздела Reviewed: 3 |
|
3) Среди семейства организма (Streptomycetaceae)
| Текст запроса: name:"periplasmic nitrate reductase" taxonomy:burkholderiaceae |
| Сколько белков: 171 |
| Сколько из раздела Reviewed: 6 |
4) Среди отдела организма (Actinobacteria)
| Текст запроса: name:"periplasmic nitrate reductase" taxonomy:betaproteobacteria |
| Сколько белков: 525 |
| Сколько из раздела Reviewed: 12 |
Поиск по альбуминам
1) Среди всех организмов
| Текст запроса: name:albumin |
| Сколько белков: 886 |
| Сколько из раздела Reviewed: 77 |
|
2) Среди Metazoa
| Текст запроса: name:albumin taxonomy:"Metazoa" |
| Сколько белков: 360 |
| Сколько из раздела Reviewed: 43 |
|
3) Среди грибов
| Текст запроса: name:albumin taxonomy:fungi |
| Сколько белков: 2 |
| Сколько из раздела Reviewed: 0 |
|
Поиск по трипсину
1) По слову трипсин
| Текст запроса: name:trypsin |
| Сколько белков: 18951 |
| Сколько из раздела Reviewed: 311 |
2) Ингибиторы
| Текст запроса: name:trypsin name:inhibitor |
| Сколько белков: 3914 |
| Сколько из раздела Reviewed: 210 |
© Сафронов Вячеслав, 2018
|